經過上百萬年的進化，熊貓一族經歷了無數艱難險阻，走到今天。雖然瀕臨滅絕的熊貓接受了人類的細心呵護，但是一場史無前例的災難即將席卷它們的棲息地，狂風暴雨會引發洪水，毀滅熊貓一族。擔心子孫的命運，祖先們向熊貓菩薩（趙忠祥配音）請教，菩薩預言將有一只繼承了祖先們智慧的超級熊貓降生，拯救本民族的命運。與此同時，森林中名叫潘迪（何炅配音）的小熊貓誕生，此時此刻他還并不知曉自己所肩負的使命。調皮頑劣的潘迪惹出不少的麻煩，也經歷了諸多的考驗，同時結交了許多的好朋友。在祖先之一（李揚配音）的冥冥指引下，潘迪逐漸擔當起本族未來的重任……