此版《源氏物語千年之謎》由鶴橋康夫執導，不僅使用CG，還加入動作場面和科幻效果，制作費用高達十億多日元(折合人民幣7千8百多萬)，于2011年12月10日在日本全國公映。影片把原著作者紫式部(中谷美紀飾)身處的平安時期與光源氏（生田斗真飾）所在天下相交錯，兩條線索并行。一個空間中紫式部受藤原道長（東山紀之飾）任命開始創作《源氏物語》，并與藤原道長發生了愛情牽絆。另一個空間是紫式部創作出的光源氏與藤壺女御（真木陽子飾）、六條御息所（田中麗奈飾）、夕顏（蘆名星飾）等眾多女性的愛情糾葛。在關閉的創作進程中，紫式部現出了靈魂出竅的狀態，與筆下對光源氏陷入苦戀而化為生靈的六條御息所的靈魂重疊。陰陽師安倍晴明（洼冢洋介飾）發現了這個情況，開始追蹤生靈……